《大乘法苑義林章》，目前遺留下來的總共為七卷、或者編為十四卷，全書總共分為二十九章，達二十二萬餘字：
卷一：總料簡章、五心章、唯識義林、諸乘義林，共四章。
卷二：諸藏章、十二分章、斷障章、二諦義，共四章。
卷三：大種造色章、五根章、表無表色章，共三章。
卷四：歸敬章、四食章、六十二見章、八解脫章、二執章，共五章。
卷五：二十七賢聖章、大乘蘊界處義、極微章、勝定果色章、十因章、五果義、法處色義林，共七章。
卷六：三寶義林、破魔羅義林、三慧義林、三輪義林，共四章。
卷七：三身義林、佛土章，共二章。
註解《大乘法苑義林章》的註釋疏眾多，有唯識宗的傳承解釋尚有窺基的弟子 慧沼（沼闍梨）《大乘法苑義林章補闕》、慧沼的弟子 智周（濮陽大師）《大乘法苑義林章決擇記》。
以及日本僧人 善珠《法苑義鏡》，善珠法師尚有《因明論疏明燈抄》、《成唯識論述記序釋》、《唯識義燈增明記》、《唯識分量決》等著述。
另外，日本僧人南都西京藥師寺傳法相 大乘沙門釋基辨所撰的《大乘法苑義林章師子吼鈔》（又稱《大乘法苑義林章師子頻伸鈔》、簡稱為《師子吼鈔》），為目前流傳於今最為詳細的《大乘法苑義林章》註釋書。
基辨法師另有《大乘一切法相玄論》論書。
而《義林章補闕》，為基師弟子 慧沼（沼闍梨）增補《義林章》所作之註釋，除《義林章》原本的二十九章外，另行增補了三科、得非得、空義、十二支、二種生死、三求、界處、五蘊、五境、見道、二量、十業道等章。
該書雖然原本有十卷之多，但目前僅保留三卷，著實可惜。
《大乘法苑義林章》針對部分章文註釋者有：
〈表無表章〉的註釋書有中國宋朝僧人 守千《表無表章栖翫記》、日本僧人 善珠《表無表章義鏡》、 叡尊《表無表章詳體文集》。
〈五心章〉，有日本僧人 清範《五心義略記》。
〈唯識章〉的註釋書尚有民國梅光義居士《法苑義林章唯識章注》、以及歐陽竟無居士替梅光義居士《法苑義林章唯識章注》而作之《法苑義林章唯識章注敘》，太虛法師《大乘法苑義林唯識章講錄》、日僧真興《唯識義》。
基師於《義林章》內文三分義頌。
如卷第四：
釋三分義頌：
性境不隨心，獨影唯從見，帶質通情本，性種等隨應。
能食及所食，此依身所住，能見此如理，所求二諦空。
為常益有情，為不捨生死，為善無窮盡，故菩薩觀空。
為種性清淨，為得諸相好，為淨諸佛法，故菩薩觀空。
補特伽羅法，實性俱非有，此無性有性，故別立二空。
三分義頌中的「性境不隨心，獨影唯從見，帶質通情本，性種等隨應。」
最常被用到《八識規矩頌》。
有趣的是，《義林章》卷第五內文：
「又梵王等變本形類，佛前聽法，談論語言，前能變心意識已滅，以非定通識，時現在前，此所變形唯第八境，彼以何法為本質耶？第八所緣亦定果故。
由斯定果所杖本質有無不定。
故《唯識》說，契當深宗；《集量》未行，且依現教。
性境不隨心，獨影唯從見，帶質通情本，性種等隨應。」
同樣的內文也出現在基師的《大乘阿毗達磨雜集論述記》卷第五。
《義林章》二十九章皆為一氣呵成，每章皆為傑作。
如 歐陽竟無居士於《法苑義林章唯識章注敘》說：
「言說系事，事法系義。
諸佛語言，三藏十二部。
九事所攝，攝無量義。
菩薩摩訶薩毗缽舍那，知法知義。
草木暢茂，禽獸所都，上苑上林，教蘊亦爾。
是故正法積集曰法苑，妙義叢聚曰義林。
有是法苑而非義林者，西域則諸經要集出曜法句之類，此方則經律異相法苑珠林之類。
有亦法相而亦義林者，西域則地論智論之類，此方則基師法苑義林章唯一獨最。
…基師法苑義林不知章數，留貽於今二十九耳。
淄州補缺今亦略缺，注治多家唯獨數種，智周抉擇，守千棲玩，如是而已，甘露不垂，曷勝於邑！」
《義林章》實為基師傑作之一，內文有些疑似有缺文、或者有問缺答，皆於所缺文以（ ）的形式備註。
〈唯識義林〉：
本章出體從所觀、能觀體總說而建立「五重唯識觀」，所觀體為唯識，以一切法攝為自體，通觀有為、無為法，一切唯識故。
五重唯識觀：
一、遣虛存實識。
觀察遍計所執性唯有虛妄不實法所起，並沒有實體用，應觀遍計正遣空，於眾生有情來說遍計所執性實有，然實際上遍計所執性並沒有真實體故；觀查依他起性、圓成實性諸法體實有，「二智境界，應正存有，理有情無故」。
二、捨濫留純識。
雖然觀察事相、理相皆不離於識，然此八識心王內識有境有心，「心起必託內境生故」，但識說唯，不說唯境。
三、攝末歸本識。
八識心王心內所取境界一切顯然，八識心王內能取心作用也是如此。
此見、相分俱依心識而有，「離識自體本，末法必無故」。
四、隱劣顯勝識。
八識心王心及心所俱能變現一切法，所以但說唯心，「非唯心所」。
八識心王心王體殊勝於心所，心所依心王生，「隱劣不彰，唯顯勝法」。
五、遣相證性識。
「識言所表，具有理事，事為相用，遣而不取；理為性體，應求作證。」
此中大義即為顯所遣能所二覺皆為依他起性，斷此染污性故，於所執之實蛇、實繩我、法不復生愛染，「非於依他以稱遣故，皆互除遣」。
不是如依他起性執，於聖道位須斷除蛇、繩二覺，故能夠逐漸證入真實性，了達異生位幻生蛇覺空，而證悟實繩分。
於證真觀位，照見勝義諦真實性理，而能後得智見俗諦事，理事二法既能了證彰顯，人我、法我便能止息。
此即是一重所觀體。
能觀唯識，並以別境慧攝為自體。
由四尋思、四如實智，如是皆同不可得故。
《攝大乘論》說：「入所知相者，謂多聞熏習所依，非阿賴耶識所攝」者，此文唯舉無漏種子在彼位增名為聞熏，稱非藏識，非諸能觀皆唯是無漏法。
不然的話，四尋思智應不是加行智。
然諸教唯識不過五種義：
一、境唯識，但說唯識所觀境者，皆境唯識。
二、教唯識，「由自心執著」等頌，《花嚴》、《深密》等說唯識教者，皆教唯識。
三、理唯識，《三十頌》言：「是諸識轉變，分別所分別，由此彼皆無，故一切唯識。」
如是成立唯識道理，皆理唯識。
四、行唯識，「菩薩於定位」等頌，四種尋思、如實智等，皆行唯識。
五、果唯識，《佛地經》言：「大圓鏡智，諸處、境、識皆於中現。」
《如來功德莊嚴經》說：「如來無垢識，是淨無漏界，解脫一切障，圓鏡智相應。」
《唯識》亦說：「此即無漏界，不思議善常，安樂解脫身，大牟尼名法。」如是諸說，唯識得果，皆果唯識。
這裡所說的五種唯識義，總攝一切唯識義皆盡。
唯識的唯又有三種義理：
一、簡持義，簡去遍計所執生法二我，持取依他、圓成，識相、識性。
二、決定義，謂俗事中，定有真理；真理中，定有俗事。
識表之中，此二決定，顯無二取。
三、顯勝義，瞿波論師《二十唯識釋》說，此說唯識，但舉主勝，理兼心所，如言王來，非無臣佐。
今此多取簡持解唯。
那麼，識呢？心也。
由心能夠集起綵畫為主之根本故，所以經說「唯心」；八識心王分別了達之根本故，論稱為「唯識」。
或者經義通說因果義，總說「唯心」；論說唯在於因義，但稱為「唯識」。
識者，即是了別義。
異生有情於因位中，識用強的緣故，說八識心王為唯，其義並無二。
於能觀位中，智強識劣，倘若以此八識心王為境，既能明白一切法皆不離心，今為所觀，所以名為唯識。
又不離於依主，故稱之為唯識；「決斷從能，故可依智」。
「攝法歸無為之主，故言一切法皆如也；攝法歸有為之主，故言諸法皆唯識；攝法歸簡擇之主，故言一切皆般若。」
至於所觀性者，
《攝大乘論》說：「如是菩薩悟入意言似義相故，悟入遍計所執性；悟入唯識故，悟入依他起性。
若已滅除意言聞法熏習種類唯識之相，乃至爾時菩薩平等平等無分別智已得生起，悟入圓成實性。」
又說：「名事互為客，其性應尋思，於二亦當推，唯量及唯假。
實智觀無義，唯有分別三，彼無故此無，是即入三性。」
初半頌為悟入遍計所執性，次半頌悟入依他起性，後一頌悟入圓成實性。
《成唯識論》說：「非不見真如，而能了諸行，皆如幻事等，雖有而非真。」
其唯識觀通生空、法空二空觀：
四尋思、四如實智，通生、法空觀。
為生空所依，但說觀於一切法；意求一切種智，而觀法空故；為於二空，能夠生起正解之故，法空觀必帶生空觀，論所說的緣故。
國際標準書號 (ISBN)：1230003783221
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